Wentylacją naturalną można sterować. Przy określonych zyskach ciepła emitowanych z procesu do wnętrza budynku oraz zmiennej w ciągu roku i w ciągu doby temperatury zewnętrznej potrzebny jest inny strumień powietrza przewietrzającego budynek. Zależnie od położenia geograficznego instalacji różnice temperatur w ciągu roku mogą osiągać nawet 60°C, a różnice dobowe 20°C. Szczególnie ze względu na dobowe różnice temperatury trudno się tu zdawać na sterowanie ręczne.
Głównym zadaniem sterowania jest otwarcie takiej ilości otworów nawiewnych i wywiewnych, czyli wytworzenie takiego strumienia przewietrzającego, aby zapewnić pożądaną temperaturę w strefach pracy i pod dachem.

Kolejnym zadaniem systemu sterowania jest utrzymanie odpowiedniej proporcji powierzchni otworów nawiewnych do powierzchni otworów wywiewnych, żeby utrzymać na pożądanym poziomie strefę wyrównania ciśnienia wewnątrz budynku. Jest to istotne ze względów pożarowych oraz aby otwory nawiewne i wywiewne nie zamieniały swoich funkcji.
Wartością dodaną automatycznego sterowania jest możliwość zdalnego monitorowania instalacji wentylacyjnej w hali. Ponadto czujniki temperatury oraz czujniki różnicy ciśnienia pomiędzy powietrzem w hali i na zewnątrz wykorzystywane do sterowania, dają dane, których archiwizacja może posłużyć do analizy zużycia energii oraz zdarzeń nietypowych dla produkcji.


Wszystkie sytuacje wentylacyjne w budynku dają się przewidzieć i obliczyć za pomocą programu nv-calc. Dobór kryteriów sterowania zależy od rodzaju produkcji oraz priorytetów przyjętych dla komfortu pracy ludzi i właściwej eksploatacji urządzeń.
Dla projektantów wentylacji naturalnej nv-calc jest wygodnym narzędziem do tworzenia wytycznych do sterowania. Wystarczy wykonać obliczenia dla różnych temperatur zewnętrznych oraz wskazać, które czerpnie powietrza i wywietrzaki mają być w danej temperaturze otwarte, a które zamknięte, żeby uniknąć n.p. ewentualnego zamrożenia instalacji rurowych w zimie.